Le grand dossier concernant les investissements au port de Rouen porte sur le programme d'amélioration des accès nautiques. En 2012, a été menée à bien la première tranche de ce programme qui s'étale sur plusieurs années.
À Rouen, la première tranche des travaux d'amélioration a porté sur la mise au nouveau gabarit de 11,70 mètres de la section comprise entre l'estuaire de la Seine et Port-Jérôme. Deux grandes dragues aspiratrices en marche sont intervenues successivement sur ce chantier, la "Breughel" (11.800 m3 de capacité) et la "Marieke" (5.600 m3). Les travaux d'aménagement vont se poursuivre avec une seconde phase, à Courval d'une part, Hautot d'autre part. Concernant Courval, un site positionné à l'amont immédiat de Port-Jérôme, il s'agit d'éliminer un point haut.
